TY - JOUR AU - Debrauwere, H. AU - Gendrel, C. G. AU - Lechat, S. AU - Dutreix, M. PY - 1997 DA - 1997// TI - Differences and similarities between various tandem repeat sequences: minisatellites and microsatellites JO - Biochimie VL - 79 UR - https://doi.org/10.1016/S0300-9084(97)82006-8 DO - 10.1016/S0300-9084(97)82006-8 ID - Debrauwere1997 ER - TY - JOUR AU - Dharma Prasad, M. AU - Muthulakshmi, M. AU - Madhu, M. AU - Archak, S. u. n. i. l. AU - Mita, K. AU - Nagaraju, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Survey and analysis of microsatellites in the silkworm, Bombyx mori: frequency, distribution, mutations, marker potential and their conservation in heterologous species JO - Genetics VL - 169 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.104.031005 DO - 10.1534/genetics.104.031005 ID - Dharma Prasad2005 ER - TY - JOUR AU - Harr, B. AU - Kauer, M. AU - Schlötterer, C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Hitchhiking mapping: a population-based fine-mapping strategy for adaptive mutations in Drosophila melanogaster JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 99 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.202336899 DO - 10.1073/pnas.202336899 ID - Harr2002 ER - TY - JOUR AU - Ramel, C. PY - 1997 DA - 1997// TI - Mini- and microsatellites JO - Environ Health Perspect VL - 105 UR - https://doi.org/10.1289/ehp.97105s4781 DO - 10.1289/ehp.97105s4781 ID - Ramel1997 ER - TY - JOUR AU - La Rota, M. AU - Kantety, R. V. AU - Yu, J. K. AU - Sorrells, M. E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Nonrandom distribution and frequencies of genomic and EST-derived microsatellite markers in rice, wheat, and barley JO - BMC Genomics VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-6-23 DO - 10.1186/1471-2164-6-23 ID - La Rota2005 ER - TY - JOUR AU - Eckert, M. AU - Gout, L. AU - Rouxel, T. AU - Blaise, F. AU - Jedryczka, M. AU - Fitt, B. AU - Balesdent, M. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Identification and characterization of polymorphic minisatellites in the phytopathogenic ascomycete Leptosphaeria maculans JO - Curr Genet VL - 47 UR - https://doi.org/10.1007/s00294-004-0539-z DO - 10.1007/s00294-004-0539-z ID - Eckert2005 ER - TY - JOUR AU - Vergnaud, G. AU - Denoeud, F. PY - 2000 DA - 2000// TI - Minisatellites: mutability and genome architecture JO - Genome Res VL - 10 UR - https://doi.org/10.1101/gr.10.7.899 DO - 10.1101/gr.10.7.899 ID - Vergnaud2000 ER - TY - JOUR AU - Pouwels, D. AU - Simons, G. PY - 2003 DA - 2003// TI - Fingerprinting microorganisms JO - Food Technol VL - 57 ID - Pouwels2003 ER - TY - JOUR AU - Parker, P. G. AU - Snow, A. A. AU - Schug, M. D. AU - Booton, G. C. AU - Fuerst, P. A. PY - 1998 DA - 1998// TI - What molecules can tell us about populations: choosing and using a molecular marker JO - Ecology VL - 79 ID - Parker1998 ER - TY - JOUR AU - Nakamura, Y. AU - Leppert, M. AU - O'Connell, P. AU - Wolff, R. AU - Holm, T. AU - Culver, M. AU - Martin, C. AU - Fujimoto, E. AU - Hoff, M. AU - Kumlin, E. AU - White, R. PY - 1987 DA - 1987// TI - Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping JO - Science VL - 235 UR - https://doi.org/10.1126/science.3029872 DO - 10.1126/science.3029872 ID - Nakamura1987 ER - TY - JOUR AU - Arnold, J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Editorial JO - Fungal Genet Biol VL - 21 UR - https://doi.org/10.1006/fgbi.1997.0997 DO - 10.1006/fgbi.1997.0997 ID - Arnold1997 ER - TY - JOUR AU - Rouxel, T. AU - Balesdent, M. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - The stem canker (blackleg) fungus, Leptosphaeria maculans, enters the genomic era JO - Mol Plant Pathol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1111/j.1364-3703.2005.00282.x DO - 10.1111/j.1364-3703.2005.00282.x ID - Rouxel2005 ER - TY - JOUR AU - Kuhn, M. L. AU - Gout, L. AU - Howlett, B. J. AU - Melayah, D. AU - Meyer, M. AU - Balesdent, M. H. AU - Rouxel, T. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genetic linkage maps and genomic organization in Leptosphaeria maculans JO - Eur J Plant Pathol VL - 114 UR - https://doi.org/10.1007/s10658-005-3168-6 DO - 10.1007/s10658-005-3168-6 ID - Kuhn2006 ER - TY - JOUR AU - Pongam, P. AU - Osborn, T. C. AU - Williams, P. H. PY - 1998 DA - 1998// TI - Genetic analysis and identification of amplified fragment length polymorphism markers linked to the alm1 avirulence gene of Leptosphaeria maculans JO - Phytopathology VL - 88 UR - https://doi.org/10.1094/PHYTO.1998.88.10.1068 DO - 10.1094/PHYTO.1998.88.10.1068 ID - Pongam1998 ER - TY - JOUR AU - Cozijnsen, A. J. AU - Popa, K. M. AU - Purwantara, A. AU - Rolls, B. D. AU - Howlett, B. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Genome analysis of the plant pathogenic ascomycete Leptosphaeria maculans: mapping mating type and host specificity loci JO - Mol Plant Pathol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1046/j.1364-3703.2000.00033.x DO - 10.1046/j.1364-3703.2000.00033.x ID - Cozijnsen2000 ER - TY - JOUR AU - Howlett, B. J. AU - Idnurm, A. AU - Pedras, M. S. PY - 2001 DA - 2001// TI - Leptosphaeria maculans, the causal agent of blackleg disease of Brassicas JO - Fungal Genet Biol VL - 33 UR - https://doi.org/10.1006/fgbi.2001.1274 DO - 10.1006/fgbi.2001.1274 ID - Howlett2001 ER - TY - JOUR AU - Faircloth, B. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Msatcommander: detection of microsatellite repeat arrays and automated, locus-specific primer design JO - Mol Ecol Res VL - 8 UR - https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2007.01884.x DO - 10.1111/j.1471-8286.2007.01884.x ID - Faircloth2008 ER - TY - JOUR AU - Fukuoka, H. AU - Nunome, T. AU - Minamiyama, Y. AU - Kono, I. AU - Namiki, N. AU - Kojima, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Read2Marker: a data processing tool for microsatellite marker development from a large data set JO - Biotechniques VL - 39 UR - https://doi.org/10.2144/000112025 DO - 10.2144/000112025 ID - Fukuoka2005 ER - TY - JOUR AU - Dereeper, A. AU - Argout, X. AU - Billot, C. AU - Rami, J. F. AU - Ruiz, M. PY - 2007 DA - 2007// TI - SAT, a flexible and optimized Web application for SSR marker development JO - BMC Bioinformatics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-465 DO - 10.1186/1471-2105-8-465 ID - Dereeper2007 ER - TY - JOUR AU - Castelo, A. T. AU - Martins, W. AU - Gao, G. R. PY - 2002 DA - 2002// TI - TROLL-Tandem Repeat Occurrence Locator JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.4.634 DO - 10.1093/bioinformatics/18.4.634 ID - Castelo2002 ER - TY - JOUR AU - Staden, R. AU - Beal, K. F. AU - Bonfield, J. K. PY - 2000 DA - 2000// TI - The STADEN Package JO - Methods Mol Biol VL - 132 ID - Staden2000 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Gish, W. AU - Miller, W. AU - Myers, E. W. AU - Lipman, D. J. PY - 1990 DA - 1990// TI - Basic local alignment search tool JO - J Mol Biol VL - 215 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2 DO - 10.1016/S0022-2836(05)80360-2 ID - Altschul1990 ER - TY - JOUR AU - Benson, G. PY - 1999 DA - 1999// TI - Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences JO - Nucleic Acids Res VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/nar/27.2.573 DO - 10.1093/nar/27.2.573 ID - Benson1999 ER - TY - JOUR AU - Rozen, S. AU - Skaletsky, H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Primer3 on the www for general users and for biologist programmers JO - Methods Mol Biol VL - 132 ID - Rozen2000 ER - TY - JOUR AU - Bernardi, G. PY - 1993 DA - 1993// TI - The vertebrate genome: isochores and evolution JO - Mol Biol Evol VL - 10 ID - Bernardi1993 ER - TY - JOUR AU - Oliver, J. L. AU - Bernaola-Galván, P. AU - Carpena, P. AU - Román-Roldán, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - Isochore chromosome maps of eukaryotic genomes JO - Gene VL - 276 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-1119(01)00641-2 DO - 10.1016/S0378-1119(01)00641-2 ID - Oliver2001 ER - TY - JOUR AU - Gout, L. AU - Fudal, I. AU - Kuhn, M. L. AU - Blaise, F. AU - Eckert, M. AU - Cattolico, L. AU - Balesdent, M. H. AU - Rouxel, T. PY - 2006 DA - 2006// TI - Lost in the middle of nowhere: the AvrLm1 avirulence gene of the Dothideomycete Leptosphaeria maculans JO - Mol Microbiol VL - 60 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.2006.05076.x DO - 10.1111/j.1365-2958.2006.05076.x ID - Gout2006 ER - TY - JOUR AU - Haas, B. J. AU - Kamoun, S. AU - Zody, M. C. AU - Jiang, R. H. Y. AU - Handsaker, R. E. AU - Cano, L. M. AU - Grabherr, M. AU - Kodira, C. D. AU - Raffaele, S. AU - Torto-Alalibo, T. AU - Bozkurt, T. O. AU - Ah-Fong, A. M. V. AU - Alvarado, L. AU - Anderson, V. L. AU - Armstrong, M. R. AU - Avrova, A. AU - Baxter, L. AU - Beynon, J. AU - Boevink, P. C. AU - Bollmann, S. R. AU - Bos, J. I. B. AU - Bulone, V. AU - Cai, G. AU - Cakir, S. AU - Carrington, J. C. AU - Chawner, M. AU - Conti, L. AU - Costanzo, S. AU - Ewan, R. AU - Fahlgren, N. AU - Fischbach, M. A. AU - Fugelstad, J. AU - Gilroy, E. M. AU - Gnerre, S. AU - Green, P. J. AU - Grenville-Briggs, L. J. AU - Griffith, J. AU - Grünwald, N. J. AU - Horn, K. AU - Horner, N. R. AU - Hu, C. H. AU - Huitema, E. AU - Jeong, D. H. AU - Jones, A. M. E. AU - Jones, J. D. G. AU - Jones, R. W. AU - Karlsson, E. K. AU - Kunjeti, S. G. AU - Lamour, K. AU - Liu, Z. AU - Ma, L. J. AU - MacLean, D. AU - Chibucos, M. C. AU - McDonald, H. AU - McWalters, J. AU - Meijer, H. J. G. AU - Morgan, W. AU - Morris, P. F. AU - Munro, C. A. AU - O'Neill, K. AU - Ospina-Giraldo, M. AU - Pinzón, A. AU - Pritchard, L. AU - Ramsahoye, B. AU - Ren, Q. AU - Restrepo, S. AU - Roy, S. AU - Sadanandom, A. AU - Savidor, A. AU - Schornack, S. AU - Schwartz, D. C. AU - Schumann, U. D. AU - Schwessinger, B. AU - Seyer, L. AU - Sharpe, T. AU - Silvar, C. AU - Song, J. AU - Studholme, D. J. AU - Sykes, S. AU - Thines, M. AU - van de Vondervoort, P. J. I. AU - Phuntumart, V. AU - Wawra, S. AU - Weide, R. AU - Win, J. AU - Young, C. AU - Zhou, S. AU - Fry, W. AU - Meyers, B. C. AU - Van West, P. AU - Ristaino, J. AU - Govers, F. AU - Birch, P. R. J. AU - Whisson, S. C. AU - Judelson, H. S. AU - Nusbaum, C. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genome sequence and analysis of the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans JO - Nature VL - 461 UR - https://doi.org/10.1038/nature08358 DO - 10.1038/nature08358 ID - Haas2009 ER - TY - JOUR AU - Martin, F. AU - Aerts, A. AU - Ahrén, D. AU - Brun, A. AU - Danchin, E. G. AU - Duchaussoy, F. AU - Gibon, J. AU - Kohler, A. AU - Lindquist, E. AU - Pereda, V. AU - Salamov, A. AU - Shapiro, H. J. AU - Wuyts, J. AU - Blaudez, D. AU - Buée, M. AU - Brokstein, P. AU - Canbäck, B. AU - Cohen, D. AU - Courty, P. E. AU - Coutinho, P. M. AU - Delaruelle, C. AU - Detter, J. C. AU - Deveau, A. AU - DiFazio, S. AU - Duplessis, S. AU - Fraissinet-Tachet, L. AU - Lucic, E. AU - Frey-Klett, P. AU - Fourrey, C. AU - Feussner, I. AU - Gay, G. AU - Grimwood, J. AU - Hoegger, P. J. AU - Jain, P. AU - Kilaru, S. AU - Labbé, J. AU - Lin, Y. C. AU - Legué, V. AU - Le Tacon, F. AU - Marmeisse, R. AU - Melayah, D. AU - Montanini, B. AU - Muratet, M. AU - Nehls, U. AU - Niculita-Hirzel, H. AU - Oudot-Le Secq, M. P. AU - Peter, M. AU - Quesneville, H. AU - Rajashekar, B. AU - Reich, M. AU - Rouhier, N. AU - Schmutz, J. AU - Yin, T. AU - Chalot, M. AU - Henrissat, B. AU - Kües, U. AU - Lucas, S. AU - Van de Peer, Y. AU - Podila, G. K. AU - Polle, A. AU - Pukkila, P. J. AU - Richardson, P. M. AU - Rouzé, P. AU - Sanders, I. R. AU - Stajich, J. E. AU - Tunlid, A. AU - Tuskan, G. AU - Grigoriev, I. V. PY - 2008 DA - 2008// TI - The genome of Laccaria bicolor provides insights into mycorrhizal symbiosis JO - Nature VL - 452 UR - https://doi.org/10.1038/nature06556 DO - 10.1038/nature06556 ID - Martin2008 ER - TY - JOUR AU - Kraemer, L. AU - Beszteri, B. AU - Gabler-Schwarz, S. AU - Held, C. AU - Leese, F. AU - Mayer, C. AU - Pohlmann, K. AU - Frickenhaus, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - STAMP: Extensions to the STADEN sequence analysis package for high throughput interactive microsatellite marker design JO - BMC Bioinformatics VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-10-41 DO - 10.1186/1471-2105-10-41 ID - Kraemer2009 ER -