Table 1 List of primers
From: Reproducible gene targeting in recalcitrant Escherichia coli isolates
Primer | Sequence (5' - 3') |
|---|---|
SeqLA1 | CTCTCGCGTTAACGCTAGCATGGAT |
SeqLB | GTAACATCAGAGATTTTGAGACAC |
P1 | GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC |
P2 | CATATGAATATCCTCCTTAG |
AttB1LrhA | GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCT TACGGCAGATGGACGCCACATCGATT |
LrhAPmeI-1 | AGTATGAGCCGCCAGTAAGTGATAATATATGGTTTAAACTCGACGGACGATAGATAATT |
LrhAPmeI-2 | ATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAGTTTAAACCATATATTATCACTTACTGGCGGCTCA |
AttB2LrhA | GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGT CTGCTCTTGATGCCGCCTCACCATT |
LrhA5 | CAGTGATGAGCGATGACTTCAGTG |
LrhA6 | TAGAAGATTACTTTGCCTAACATA |
AttB1Lac | GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCT TACTACGGCAATGCACTCCTATAA |
LacPmeI-1 | TAACAATTTCACAGGATACAGCTATGGTTTAAACATAAGCAAAATTGCCTGATGCGCTCCGCTT |
LacPmeI-2 | AAGCGGAGCGCATCAGGCAATTTTGCTTATGTTTAAACCATAGCTGTATCCTGTGTGAAATTGTTA |
AttB2Lac | GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGT ATAAATATCTC ACACGCAATCAAATTCA |
LacZYA-1 | TTGTTGGGGCGATTCCGCATTTTGAATTTA |
LacZYA-2 | GTCAGTGGGCTGATCATTAACTAT |
AttB1Type1 | GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCT AT CTCCAGGAAATACACAGTCTGAAA |
Type1PmeI-1 | TACCTGCATTAGCAATGCCCTGTGA TTTCTGTTTAAACCATCGTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTA |
Type1PmeI-2 | TAGTG CGCGTCTGTAATTATAAGGGAAAACGATGGTTTAAACAGAAATCACAGGGCATTGCTAATGCAGGTA |
AttB2Type1 | GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGT GTACCAGCG CCAGGTCTGTTCCATGATTT |
Type1-1 | GAAATATGTTTCCTGGTTTTTGGCTTGTAA |
Type1-2 | ACGACAGACCACACCAGGCCTGCGTCTT |
Type1DW1 | TATTGCTAACCCAGCACAGCTAGTGCGCGTCTGTAATTATAAGGGAAAACG TTGAGCGATTGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC |
Type1DW2 | GTTTTAGCTTCAGGTAATATTGCGTACCTGCATTAGCAATGCCCTGTGATTTCT TTAGCCATGGTCCATATGAATATCCTCCTTAG |
LrhADW1 | GTGTGCACAGCATTAACCAGCTCAGTATGAGCCGCCAGTAAGTGATAATA TGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC |
LrhADW2 | CAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTC CATATGAATATCCTCCTTAG |
LacZDW1 | GTATGTTGTGTGAAATTGTGAGCGAATAACAATTTCACACAGGATACAGCT TTGAGCGATTGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC |
LacZDW2 | TGAAATTGTAGGCCTGATAAGCGGAGCGCATCAGGCAATTTTGCTTATTTA TTAGCCATGGTCCATATGAATATCCTCCTTAG |
Type1DWL1 | CGTAAGCTGACGAATCAGCAGGAATAATCGCTAGGGACCTAAGAATTAGCATGATAATAGCCACTAAGAAATTACTGCGCTCCATGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC |
Type1DWL2 | TTATCTGGCCTACAAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTTAGCTTCAGGTAATATTGCGTACCAGCATTAGCAATGTCCTGTGATTTCTCATATGAATATCCTCCTTAG |
LrhADWL1 | GGGAGGCACATTACAAATGGAATTGCTTGTTTGTGTGTGCACAGCATTAACCAGCTCAGTATGACCCGCCAGTAAGTGATAATATGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC |
LrhADWL2 | CTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGACCATATGAATATCCTCCTTAG |
LacZDWL1 | TTAGGCACCCCAGTCTTTAC ACTCTATGTG TCCGGCTCGT ATGTTGTGTG AAATTGTGAGCGAATAACAATTTCACACAG GATACAGCTTTGAGCGATT GTGTAGGCTG GAGCTGCTTC |
LacZDWL2 | GCGGCGTGAACACCTTATCC GGCCTACGTA GATCTCTGAA ATTGTAGGCC TGATAAGCGG AGCGCATCAGGCAATTTTGC TTATTTATTAGCCATGGTCCATA TGAATATCCT CCTTAG |