Skip to main content

Table 3 Estimation of uncorrected and corrected FST, frequency of null alleles and deviation from Hardy-Weinberg equilibrium

From: Characterization of variable EST SSR markers for Norway spruce (Picea abies L.)

Locus name

Fst

Fst (ENA)

Gusswerk

Mayrhofen

   

Fn

HWE p-value

Fn

HWE p-value

Pa_5

0.046

0.046

0.000

0.340

0.000

0.001*

Pa_12

0.000

0.000

0.000

0.000*

0.000

0.000*

Pa_22

0.065

0.065

0.167

0.038*

0.006

0.000*

Pa_25

0.007

0.031

0.127

0.004*

0.244

0.000*

Pa_28

0.004

0.003

0.191

0.000*

0.274

0.003*

Pa_29

0.035

0.036

0.000

0.088

0.008

0.001*

Pa_33

0.020

0.020

0.000

0.000*

0.000

0.000*

Pa_36

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

1.000

Pa_41

0.007

0.041

0.293

0.000*

0.146

1.000

Pa_42

0.107

0.144

0.990

n.a.

0.854

0.023*

Pa_43

0.000

0.000

0.000

1.000

0.100

0.013*

Pa_44

0.000

0.000

0.060

0.009*

0.120

0.000*

Pa_47

0.000

0.000

0.000

0.212

0.000

0.097

Pa_48

0.000

0.000

0.046

0.074

0.047

0.256

Pa_49

0.000

0.000

0.000

0.000*

0.000

0.000*

Pa_50

0.011

0.023

0.087

0.116

0.000

1.000

Pa_51

0.288

0.288

0.979

1.000

0.571

0.000*

Pa_52

0.006

0.006

0.000

0.000*

0.000

0.000*

Pa_53

0.000

0.000

0.990

n.a.

n.a.

n.a.

Pa_55

0.000

0.000

0.227

0.000*

0.323

0.000*

Pa_56

0.019

0.018

0.281

0.003*

0.141

0.001*

Pa_59

0.036

0.057

0.000

1.000

0.056

0.342

Pa_60

0.006

0.006

0.694

0.202

0.597

0.005*

Mean

0.027

0.033

    
  1. FST, fixation index (Weir, 1996), FST(ENA), fixation index without null alleles (ENA), Fn, frequency of null alleles, HWE p-value, test for deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, *, significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium (P < 0.05), n.a., not analyzed