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Table 1 Comparison of GFF-Ex with other tools

From: GFF-Ex: a genome feature extraction package

  Galaxy Cufflinks BioPerl GFF-Ex Sangers’ Josep Abrils’
Intergenic N N N Y N N
Gene Y Y Y Y Y Y
Exon Y Y Y Y Y Y
Intron Y N N Y N N
CDS Y Y Y Y Y Y
mRNA Y Y Y Y Y Y
UTRs Y Y Y Y Y Y
UpstreamToGene N N N Y N N