Table 1 Comparison of GFF-Ex with other tools
|  | Galaxy | Cufflinks | BioPerl | GFF-Ex | Sangers’ | Josep Abrils’ |
|---|---|---|---|---|---|---|
Intergenic | N | N | N | Y | N | N |
Gene | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
Exon | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
Intron | Y | N | N | Y | N | N |
CDS | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
mRNA | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
UTRs | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
UpstreamToGene | N | N | N | Y | N | N |