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Table 1 Mutations comparison of 21 protein sequences of the Hemagglutinin subunit HA2

From: Cleavage site and Ectodomain of HA2 sub-unit sequence of three equine influenza virus isolated in Morocco

  Cleavage site Ectodomain TM
FP Short β sheet Helix A Helix B Helix c Coiled coil Helix D Helix E-H
HA residual 323 325 326 327 328 347 355 369 372 379 385 386 387 391 414 430 431 450 462 464 465 476 479 483 486 487 489 492 496 503 504 527 528 536 540
HA2 Residual -6 -4 -3 -2 -1 18 26 40 43 50 56 57 58 62 85 101 102 121 133 135 136 147 150 154 157 158 160 163 167 174 175 198 199 207 211
A/equine/Miami/1963 V E K Q I V Y S A G F E K K E A L K M N G A E N Y D D R L R G I C M E
A/equine/Nador/1/1997 . . . . . . . . . . I . R . D . . . . G . . G . . . Y . . K S . . L Q
A/equine/Essaouira/2/2004 . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . T . N . . . . . . . . Q
A/equine/Essaouira/3/2004 . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . T . N . . . . . . F . Q
A/equine/Algiers/1/1972 . . . R L . H . . . I . . . . T . R . . . . . . . . . . . . S . . . Q
A/equine/Tokyo/2/1971 I G . R L I H . . . I . . . . T . R I . . . . . . . . . . . . . . . Q
A/equine/Uruguay/1/1963 . . R . . I . . . . I G . . . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . Q
A/equine/Sao Paulo/6/1963 . . R R L I . . . . I G . . . . I . . . R T . . . N . . V K . . . . Q
A/equine/Sachiyama/1/1971 I . . R L I H . . . I . . . . T . R I . . . . . . . . . . . . . . . Q
A/equine/Italy/1199/1992 . . . . . . . . . . I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K S . . . Q
A/equine/Egypt/2008 . . . . . . . . . . I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . V . . Q
A/equine/Tiaret/1/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/2/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/3/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/4/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/5/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/6/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . C . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/7/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/8/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/9/2011 . . . . . . . . T E I . R . . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
A/equine/Tiaret/10/2011 . . . . V . . . T E I . R E . . . . . G . . G . . . Y . . K . . . . Q
  1. Accession numbers: A/equine/Miami/1963, AAA43164; A/equine/Nador/1/1997, AFJ69903; A/equine/Essaouira/2/2004, AFJ69905; A/equine/Essaouira/3/2004, AFJ69909; A/equine/Algiers/1/1972, ACF22126; A/equine/Italy/1199/1992, ACD85308; A/equine/Sachiyama/1/1971, ACI25735; A/equine/Sao Paulo/6/1963, ACD85264; A/equine/Egypt/6066NAMRU3-VSVRI/2008 (A/equine/Egypt/2008), ACH95682; A/equine/Uruguay/1/1963, ACD85418; A/equine/Tokyo/2/1971, AEM60147; A/equine/Tiaret/1/2011, AGR54591; A/equine/Tiaret/2/2011, AGR54592; A/equine/Tiaret/3/2011, AGR54593; A/equine/Tiaret/4/2011, AGR54594; A/equine/Tiaret/5/2011, AGR54595; A/equine/Tiaret/6/2011, AGR54596; A/equine/Tiaret/7/2011, AGR54597; A/equine/Tiaret/8/2011, AGR54598; A/equine/Tiaret/9/2011, AGR54599; A/equine/Tiaret/10/2011, AGR54600.