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Table 1 Mutations comparison of 21 protein sequences of the Hemagglutinin subunit HA2

From: Cleavage site and Ectodomain of HA2 sub-unit sequence of three equine influenza virus isolated in Morocco

 

Cleavage site

Ectodomain

TM

FP

Short β sheet

Helix A

Helix B

Helix c Coiled coil

Helix D

Helix E-H

HA residual

323

325

326

327

328

347

355

369

372

379

385

386

387

391

414

430

431

450

462

464

465

476

479

483

486

487

489

492

496

503

504

527

528

536

540

HA2 Residual

-6

-4

-3

-2

-1

18

26

40

43

50

56

57

58

62

85

101

102

121

133

135

136

147

150

154

157

158

160

163

167

174

175

198

199

207

211

A/equine/Miami/1963

V

E

K

Q

I

V

Y

S

A

G

F

E

K

K

E

A

L

K

M

N

G

A

E

N

Y

D

D

R

L

R

G

I

C

M

E

A/equine/Nador/1/1997

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

I

.

R

.

D

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

S

.

.

L

Q

A/equine/Essaouira/2/2004

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

I

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

T

.

N

.

.

.

.

.

.

.

.

Q

A/equine/Essaouira/3/2004

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

I

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

T

.

N

.

.

.

.

.

.

F

.

Q

A/equine/Algiers/1/1972

.

.

.

R

L

.

H

.

.

.

I

.

.

.

.

T

.

R

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

S

.

.

.

Q

A/equine/Tokyo/2/1971

I

G

.

R

L

I

H

.

.

.

I

.

.

.

.

T

.

R

I

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

Q

A/equine/Uruguay/1/1963

.

.

R

.

.

I

.

.

.

.

I

G

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

Q

A/equine/Sao Paulo/6/1963

.

.

R

R

L

I

.

.

.

.

I

G

.

.

.

.

I

.

.

.

R

T

.

.

.

N

.

.

V

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Sachiyama/1/1971

I

.

.

R

L

I

H

.

.

.

I

.

.

.

.

T

.

R

I

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

Q

A/equine/Italy/1199/1992

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

S

.

.

.

Q

A/equine/Egypt/2008

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

V

.

.

Q

A/equine/Tiaret/1/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/2/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/3/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/4/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/5/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/6/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

C

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/7/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/8/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/9/2011

.

.

.

.

.

.

.

.

T

E

I

.

R

.

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

A/equine/Tiaret/10/2011

.

.

.

.

V

.

.

.

T

E

I

.

R

E

.

.

.

.

.

G

.

.

G

.

.

.

Y

.

.

K

.

.

.

.

Q

  1. Accession numbers: A/equine/Miami/1963, AAA43164; A/equine/Nador/1/1997, AFJ69903; A/equine/Essaouira/2/2004, AFJ69905; A/equine/Essaouira/3/2004, AFJ69909; A/equine/Algiers/1/1972, ACF22126; A/equine/Italy/1199/1992, ACD85308; A/equine/Sachiyama/1/1971, ACI25735; A/equine/Sao Paulo/6/1963, ACD85264; A/equine/Egypt/6066NAMRU3-VSVRI/2008 (A/equine/Egypt/2008), ACH95682; A/equine/Uruguay/1/1963, ACD85418; A/equine/Tokyo/2/1971, AEM60147; A/equine/Tiaret/1/2011, AGR54591; A/equine/Tiaret/2/2011, AGR54592; A/equine/Tiaret/3/2011, AGR54593; A/equine/Tiaret/4/2011, AGR54594; A/equine/Tiaret/5/2011, AGR54595; A/equine/Tiaret/6/2011, AGR54596; A/equine/Tiaret/7/2011, AGR54597; A/equine/Tiaret/8/2011, AGR54598; A/equine/Tiaret/9/2011, AGR54599; A/equine/Tiaret/10/2011, AGR54600.