TY - JOUR AU - Kent, W. J. AU - Sugnet, C. W. AU - Furey, T. S. AU - Roskin, K. M. AU - Pringle, T. H. AU - Zahler, A. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - The human genome browser at UCSC JO - Genome Res. VL - 12 UR - https://doi.org/10.1101/gr.229102. Article published online before print in May 2002 DO - 10.1101/gr.229102. Article published online before print in May 2002 ID - Kent2002 ER - TY - STD TI - Donlin MJ. Using the Generic Genome Browser (GBrowse). Curr Protoc Bioinformatics. 2009;Chapter 9(9):9. ID - ref2 ER - TY - JOUR AU - Flicek, P. AU - Amode, M. R. AU - Barrell, D. AU - Beal, K. AU - Billis, K. AU - Brent, S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Ensembl 2014 JO - Nucleic Acids Res. VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt1196 DO - 10.1093/nar/gkt1196 ID - Flicek2014 ER - TY - JOUR AU - Skinner, M. E. AU - Uzilov, A. V. AU - Stein, L. D. AU - Mungall, C. J. AU - Holmes, I. H. PY - 2009 DA - 2009// TI - JBrowse: a next-generation genome browser JO - Genome Res. VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gr.094607.109 DO - 10.1101/gr.094607.109 ID - Skinner2009 ER - TY - JOUR AU - Hsu, F. AU - Pringle, T. H. AU - Kuhn, R. M. AU - Karolchik, D. AU - Diekhans, M. AU - Haussler, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - The UCSC Proteome Browser JO - Nucleic Acids Res. VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki100 DO - 10.1093/nar/gki100 ID - Hsu2005 ER - TY - JOUR AU - Berman, H. M. AU - Westbrook, J. AU - Feng, Z. AU - Gilliland, G. AU - Bhat, T. N. AU - Weissig, H. PY - 2000 DA - 2000// TI - The Protein Data Bank JO - Nucleic Acids Res. VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/nar/28.1.235 DO - 10.1093/nar/28.1.235 ID - Berman2000 ER - TY - JOUR AU - Hunter, S. AU - Jones, P. AU - Mitchell, A. AU - Apweiler, R. AU - Attwood, T. K. AU - Bateman, A. PY - 2012 DA - 2012// TI - InterPro in 2011: new developments in the family and domain prediction database JO - Nucleic Acids Res. VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr948 DO - 10.1093/nar/gkr948 ID - Hunter2012 ER - TY - JOUR AU - Harris, T. W. AU - Baran, J. AU - Bieri, T. AU - Cabunoc, A. AU - Chan, J. AU - Chen, W. J. PY - 2014 DA - 2014// TI - WormBase 2014: new views of curated biology JO - Nucleic Acids Res. VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt1063 DO - 10.1093/nar/gkt1063 ID - Harris2014 ER - TY - JOUR AU - Cherry, J. M. AU - Hong, E. L. AU - Amundsen, C. AU - Balakrishnan, R. AU - Binkley, G. AU - Chan, E. T. PY - 2012 DA - 2012// TI - Saccharomyces Genome Database: the genomics resource of budding yeast JO - Nucleic Acids Res. VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr1029 DO - 10.1093/nar/gkr1029 ID - Cherry2012 ER - TY - STD TI - Garcia L, Yachdav G, Martin MJ. FeatureViewer, a BioJS component for visualization of position-based annotations in protein sequences. F1000Res. 2014;3:47. ID - ref10 ER - TY - JOUR AU - Gomez, J. AU - Garcia, L. J. AU - Salazar, G. A. AU - Villaveces, J. AU - Gore, S. AU - Garcia, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - BioJS: an open source JavaScript framework for biological data visualization JO - Bioinformatics VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btt100 DO - 10.1093/bioinformatics/btt100 ID - Gomez2013 ER - TY - JOUR AU - Mukhyala, K. AU - Masselot, A. PY - 2014 DA - 2014// TI - Visualization of protein sequence features using JavaScript and SVG with pViz.js JO - Bioinformatics VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu567 DO - 10.1093/bioinformatics/btu567 ID - Mukhyala2014 ER - TY - JOUR AU - Desiere, F. AU - Deutsch, E. W. AU - King, N. L. AU - Nesvizhskii, A. I. AU - Mallick, P. AU - Eng, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - The PeptideAtlas project JO - Nucleic Acids Res. VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkj040 DO - 10.1093/nar/gkj040 ID - Desiere2006 ER - TY - JOUR AU - Reynolds, S. M. AU - Kall, L. AU - Riffle, M. E. AU - Bilmes, J. A. AU - Noble, W. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Transmembrane topology and signal peptide prediction using dynamic bayesian networks JO - PLoS Comput. Biol. VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000213 DO - 10.1371/journal.pcbi.1000213 ID - Reynolds2008 ER - TY - JOUR AU - Jones, D. T. PY - 1999 DA - 1999// TI - Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices JO - J. Mol. Biol. VL - 292 UR - https://doi.org/10.1006/jmbi.1999.3091 DO - 10.1006/jmbi.1999.3091 ID - Jones1999 ER - TY - JOUR AU - McDonnell, A. V. AU - Jiang, T. AU - Keating, A. E. AU - Berger, B. PY - 2006 DA - 2006// TI - Paircoil2: improved prediction of coiled coils from sequence JO - Bioinformatics VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti797 DO - 10.1093/bioinformatics/bti797 ID - McDonnell2006 ER - TY - JOUR AU - Ward, J. J. AU - McGuffin, L. J. AU - Bryson, K. AU - Buxton, B. F. AU - Jones, D. T. PY - 2004 DA - 2004// TI - The DISOPRED server for the prediction of protein disorder JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bth195 DO - 10.1093/bioinformatics/bth195 ID - Ward2004 ER -