Marker | Primer sequence 5′- > 3′ | Repeat motif | Tm (°C) | Size (bp) | N | K | Ho | He | PI |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Tt5 | F: ACGGAATGTGTTAACGTGCG R: TATGTGCTCGTCGTTCTCGC | TGCG | 60.5 | 254–322 | 14 | 10 | 0.71 | 0.86 | 0.04 |
Tt10b,c | F: ACCGGAGAGCGGTAGAGACC R: TACCCGGCCATTAGAACTCC | AGGT | 58.3 | 286–320 | 16 | 11 | 0.5 | 0.85 | 0.04 |
Tt18 | F: GGTGATGGTCGATAGTTTCCG R: ACGACGTATGGGTTCGTGC | AACG | 60.5 | 196–244 | 16 | 7 | 0.44 | 0.58 | 0.20 |
Tt20 | F: ATGCAGAGTCAGAGGACCGC R: GAATTGTCTCCACATTATCAAGGG | TGCG | 60.5 | 218–236 | 15 | 7 | 0.67 | 0.78 | 0.08 |
Tt2b,c | F: AATGTCGGACGTTTATGGTCG R: GTATCATCGGCACTGCAACG | TTGCG | 56.2 | 266–314 | 16 | 7 | 0.44 | 0.77 | 0.09 |
Tt7a,b,c | F: GCAGTATGACTTCTGATCCTTTCG R: CACGTTAATCCAGCACTCCG | TGCG | 66.2 | 156–176 | 15 | 4 | 0.20 | 0.58 | 0.26 |
Tt9a | F: ACGCACTGTGTATGTGTGCG R: AGCATATAAGTACGAATAACTGAGATTGG | TGCG | 66.2 | 188–264 | 10 | 12 | 0.70 | 0.83 | 0.04 |
Tt16 | F: TCGATTTATTAGAAAGGCTTGCG R: TGCACGAGAGTGTTTGTAGCC | AGTG | 55.1 | 272–288 | 13 | 5 | 0.54 | 0.74 | 0.11 |
Tt6b,c | F: TTATATCGATGGCTTCCCACC R: CCCTCTCGATATCTACTCGGTACG | AGGT | 57.3 | 318–358 | 15 | 11 | 0.27 | 0.85 | 0.04 |
Tt14a | F: AAGTCGCGTAATGACGATGC R: GAGATATACCTGATTCAACGTCGC | ATAC | 57.3 | 256–378 | 15 | 10 | 0.60 | 0.77 | 0.08 |
Tt15a,b,c | F: TGCCTTCATATATGTGCCTTCG R: TGTCGTTAAGAGTTACAGAACAGGG | TGCG | 65.3 | 238–304 | 12 | 12 | 0.42 | 0.88 | 0.03 |
Tt17b,c | F: TCACTCAAATCGAATATGTAGATGAGG R: CCCACAGTAATGTCCTAGTAATGTCC | TGCG | 64.4 | 148–198 | 15 | 11 | 0.47 | 0.88 | 0.03 |