TY - JOUR AU - He, H. AU - Luthringer, D. J. AU - Hui, P. AU - Lau, S. K. AU - Weiss, L. M. AU - Chu, P. G. PY - 2008 DA - 2008// TI - Expression of CD56 and WT1 in ovarian stroma and ovarian stromal tumors JO - Am J Surgical Pathol VL - 32 ID - He2008 ER - TY - STD TI - Deavers MT, Malpica A, Liu J, Broaddus R, Silva EG: Ovarian sex cord-stromal tumors: an immunohistochemical study including a comparison of calretinin and inhibin. Modern pathology: an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc 2003, 16(6):584-590. ID - ref2 ER - TY - JOUR AU - Kiechle-Schwarz, M. AU - Pfleiderer, A. AU - Sreekantaiah, C. AU - Berger, C. S. AU - Medchill, M. T. AU - Sandberg, A. A. PY - 1991 DA - 1991// TI - Cluster of trisomy 12 to tumors of the female genitourinary tract JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 54 ID - Kiechle-Schwarz1991 ER - TY - JOUR AU - Pandis, N. AU - Heim, S. AU - Bardi, G. AU - Floderus, U. M. AU - Willen, H. AU - Mandahl, N. AU - Mitelman, F. PY - 1991 DA - 1991// TI - Chromosome analysis of 96 uterine leiomyomas JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 55 ID - Pandis1991 ER - TY - JOUR AU - Cin, P. AU - Moerman, P. AU - Wever, I. AU - Berghe, H. PY - 1992 DA - 1992// TI - Numerical chromosome aberrations in fibrothecoma JO - Tumori VL - 78 ID - Cin1992 ER - TY - JOUR AU - Izutsu, T. AU - Kudo, T. AU - Miura, F. AU - Nishiya, I. PY - 1995 DA - 1995// TI - Numerical and structural chromosome abnormalities in an ovarian fibrothecoma JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 83 ID - Izutsu1995 ER - TY - JOUR AU - Micci, F. AU - Haugom, L. AU - Abeler, V. M. AU - Trope, C. G. AU - Danielsen, H. E. AU - Heim, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Consistent numerical chromosome aberrations in thecofibromas of the ovary JO - Virchows Arch VL - 452 ID - Micci2008 ER - TY - JOUR AU - Leung, W. Y. AU - Schwartz, P. E. AU - Ng, H. T. AU - Yang-Feng, T. L. PY - 1990 DA - 1990// TI - Trisomy 12 in benign fibroma and granulosa cell tumor of the ovary JO - Gynecol Oncol VL - 38 ID - Leung1990 ER - TY - JOUR AU - Liang, S. B. AU - Sonobe, H. AU - Taguchi, T. AU - Takeuchi, T. AU - Furihata, M. AU - Yuri, K. AU - Ohtsuki, Y. PY - 2001 DA - 2001// TI - Tetrasomy 12 in ovarian tumors of thecoma-fibroma group: a fluorescence in situ hybridization analysis using paraffin sections JO - Pathol Int VL - 51 ID - Liang2001 ER - TY - JOUR AU - Persons, D. L. AU - Hartmann, L. C. AU - Herath, J. F. AU - Keeney, G. L. AU - Jenkins, R. B. PY - 1994 DA - 1994// TI - Fluorescence in situ hybridization analysis of trisomy 12 in ovarian tumors JO - Am J Clin Pathol VL - 102 ID - Persons1994 ER - TY - JOUR AU - Fletcher, J. A. AU - Gibas, Z. AU - Donovan, K. AU - Perez-Atayde, A. AU - Genest, D. AU - Morton, C. C. AU - Lage, J. M. PY - 1991 DA - 1991// TI - Ovarian granulosa-stromal cell tumors are characterized by trisomy 12 JO - Am J Pathol VL - 138 ID - Fletcher1991 ER - TY - JOUR AU - Schofield, D. E. AU - Fletcher, J. A. PY - 1992 DA - 1992// TI - Trisomy 12 in pediatric granulosa-stromal cell tumors. Demonstration by a modified method of fluorescence in situ hybridization on paraffin-embedded material JO - Am J Pathol VL - 141 ID - Schofield1992 ER - TY - JOUR AU - Streblow, R. C. AU - Dafferner, A. J. AU - Nelson, M. AU - Fletcher, M. AU - West, W. W. AU - Stevens, R. K. AU - Gatalica, Z. AU - Novak, D. AU - Bridge, J. A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Imbalances of chromosomes 4, 9, and 12 are recurrent in the thecoma-fibroma group of ovarian stromal tumors JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 178 ID - Streblow2007 ER - TY - JOUR AU - Hunter, S. M. AU - Anglesio, M. S. AU - Sharma, R. AU - Gilks, C. B. AU - Melnyk, N. AU - Chiew, Y. E. AU - deFazio, A. AU - Longacre, T. A. AU - Huntsman, D. G. PY - 2011 DA - 2011// TI - Copy number aberrations in benign serous ovarian tumors: a case for reclassification JO - Clin Cancer Res VL - 17 ID - Hunter2011 ER - TY - JOUR AU - Bryan, E. J. AU - Watson, R. H. AU - Davis, M. AU - Hitchcock, A. AU - Foulkes, W. D. AU - Campbell, I. G. PY - 1996 DA - 1996// TI - Localization of an ovarian cancer tumor suppressor gene to a 0.5-cM region between D22S284 and CYP2D, on chromosome 22q JO - Cancer Res VL - 56 ID - Bryan1996 ER - TY - JOUR AU - Anglesio, M. S. AU - Arnold, J. M. AU - George, J. AU - Tinker, A. V. AU - Tothill, R. AU - Waddell, N. AU - Simms, L. AU - Locandro, B. AU - Fereday, S. AU - Traficante, N. PY - 2008 DA - 2008// TI - Mutation of ERBB2 provides a novel alternative mechanism for the ubiquitous activation of RAS-MAPK in ovarian serous low malignant potential tumors JO - Mol Cancer Res VL - 6 ID - Anglesio2008 ER - TY - JOUR AU - Tothill, R. W. AU - Tinker, A. V. AU - George, J. AU - Brown, R. AU - Fox, S. B. AU - Lade, S. AU - Johnson, D. S. AU - Trivett, M. K. AU - Etemadmoghadam, D. AU - Locandro, B. PY - 2008 DA - 2008// TI - Novel molecular subtypes of serous and endometrioid ovarian cancer linked to clinical outcome JO - Clin Cancer Res VL - 14 ID - Tothill2008 ER - TY - JOUR AU - Hunter, S. M. AU - Gorringe, K. L. AU - Christie, M. AU - Rowley, S. M. AU - Bowtell, D. D. PY - 2012 DA - 2012// TI - Australian Ovarian Cancer Study G, Campbell IG: pre-invasive ovarian mucinous tumors are characterized by CDKN2A and RAS pathway aberrations JO - Clin Cancer Res VL - 18 ID - Hunter2012 ER - TY - JOUR AU - Li, H. AU - Durbin, R. PY - 2010 DA - 2010// TI - Fast and accurate long-read alignment with Burrows-Wheeler transform JO - Bioinformatics VL - 26 ID - Li2010 ER - TY - STD TI - Li H: Aligning sequence reads, clone sequences and assembly contigs with BWA-MEM. Quantitative Biology - Genomics 2013. ID - ref20 ER - TY - JOUR AU - McKenna, A. AU - Hanna, M. AU - Banks, E. AU - Sivachenko, A. AU - Cibulskis, K. AU - Kernytsky, A. AU - Garimella, K. AU - Altshuler, D. AU - Gabriel, S. AU - Daly, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - The Genome Analysis Toolkit: a MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data JO - Genome Res VL - 20 ID - McKenna2010 ER - TY - STD TI - Van der Auwera GA, Carneiro MO, Hartl C, Poplin R, del Angel G, Levy-Moonshine A, Jordan T, Shakir K, Roazen D, Thibault J et al: From FastQ Data to High-Confidence Variant Calls: The Genome Analysis Toolkit Best Practices Pipeline. In: Current Protocols in Bioinformatics. John Wiley & Sons, Inc.; 2002. ID - ref22 ER - TY - JOUR AU - Ye, K. AU - Schulz, M. H. AU - Long, Q. AU - Apweiler, R. AU - Ning, Z. PY - 2009 DA - 2009// TI - Pindel: a pattern growth approach to detect break points of large deletions and medium sized insertions from paired-end short reads JO - Bioinformatics VL - 25 ID - Ye2009 ER - TY - JOUR AU - Koboldt, D. C. AU - Zhang, Q. AU - Larson, D. E. AU - Shen, D. AU - McLellan, M. D. AU - Lin, L. AU - Miller, C. A. AU - Mardis, E. R. AU - Ding, L. AU - Wilson, R. K. PY - 2012 DA - 2012// TI - VarScan 2: somatic mutation and copy number alteration discovery in cancer by exome sequencing JO - Genome Res VL - 22 ID - Koboldt2012 ER - TY - JOUR AU - Cibulskis, K. AU - Lawrence, M. S. AU - Carter, S. L. AU - Sivachenko, A. AU - Jaffe, D. AU - Sougnez, C. AU - Gabriel, S. AU - Meyerson, M. AU - Lander, E. S. AU - Getz, G. PY - 2013 DA - 2013// TI - Sensitive detection of somatic point mutations in impure and heterogeneous cancer samples JO - Nat Biotechnol VL - 31 ID - Cibulskis2013 ER - TY - JOUR AU - Larson, D. E. AU - Harris, C. C. AU - Chen, K. AU - Koboldt, D. C. AU - Abbott, T. E. AU - Dooling, D. J. AU - Ley, T. J. AU - Mardis, E. R. AU - Wilson, R. K. AU - Ding, L. PY - 2012 DA - 2012// TI - SomaticSniper: identification of somatic point mutations in whole genome sequencing data JO - Bioinformatics VL - 28 ID - Larson2012 ER - TY - JOUR AU - Roth, A. AU - Ding, J. AU - Morin, R. AU - Crisan, A. AU - Ha, G. AU - Giuliany, R. AU - Bashashati, A. AU - Hirst, M. AU - Turashvili, G. AU - Oloumi, A. PY - 2012 DA - 2012// TI - JointSNVMix: a probabilistic model for accurate detection of somatic mutations in normal/tumour paired next-generation sequencing data JO - Bioinformatics VL - 28 ID - Roth2012 ER - TY - JOUR AU - Lan, Y. AU - Zhang, Y. AU - Wang, J. AU - Lin, C. AU - Ittmann, M. M. AU - Wang, F. PY - 2008 DA - 2008// TI - Aberrant expression of Cks1 and Cks2 contributes to prostate tumorigenesis by promoting proliferation and inhibiting programmed cell death JO - Int J Cancer VL - 123 ID - Lan2008 ER - TY - JOUR AU - Kang, M. A. AU - Kim, J. T. AU - Kim, J. H. AU - Kim, S. Y. AU - Kim, Y. H. AU - Yeom, Y. I. AU - Lee, Y. AU - Lee, H. G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Upregulation of the cycline kinase subunit CKS2 increases cell proliferation rate in gastric cancer JO - J Cancer Res Clin Oncol VL - 135 ID - Kang2009 ER - TY - JOUR AU - Shen, D. Y. AU - Fang, Z. X. AU - You, P. AU - Liu, P. G. AU - Wang, F. AU - Huang, C. L. AU - Yao, X. B. AU - Chen, Z. X. AU - Zhang, Z. Y. PY - 2010 DA - 2010// TI - Clinical significance and expression of cyclin kinase subunits 1 and 2 in hepatocellular carcinoma JO - Liver Int VL - 30 ID - Shen2010 ER - TY - JOUR AU - Bullinger, L. AU - Schlenk, R. F. AU - Gotz, M. AU - Botzenhardt, U. AU - Hofmann, S. AU - Russ, A. C. AU - Babiak, A. AU - Zhang, L. AU - Schneider, V. AU - Dohner, K. PY - 2013 DA - 2013// TI - PRAME-induced inhibition of retinoic acid receptor signaling-mediated differentiation–a possible target for ATRA response in AML without t(15;17) JO - Clin Cancer Res VL - 19 ID - Bullinger2013 ER - TY - JOUR AU - Doolan, P. AU - Clynes, M. AU - Kennedy, S. AU - Mehta, J. P. AU - Crown, J. AU - O’Driscoll, L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Prevalence and prognostic and predictive relevance of PRAME in breast cancer JO - Breast Cancer Res Treat VL - 109 ID - Doolan2008 ER - TY - JOUR AU - Partheen, K. AU - Levan, K. AU - Osterberg, L. AU - Claesson, I. AU - Fallenius, G. AU - Sundfeldt, K. AU - Horvath, G. PY - 2008 DA - 2008// TI - Four potential biomarkers as prognostic factors in stage III serous ovarian adenocarcinomas JO - Int J Cancer VL - 123 ID - Partheen2008 ER - TY - JOUR AU - Haqq, C. AU - Nosrati, M. AU - Sudilovsky, D. AU - Crothers, J. AU - Khodabakhsh, D. AU - Pulliam, B. L. AU - Federman, S. AU - Miller, J. R. AU - Allen, R. E. AU - Singer, M. I. PY - 2005 DA - 2005// TI - The gene expression signatures of melanoma progression JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 102 ID - Haqq2005 ER - TY - JOUR AU - Xu, J. H. AU - Wang, Y. AU - Xu, D. PY - 2019 DA - 2019// TI - CKS2 promotes tumor progression and metastasis and is an independent predictor of poor prognosis in epithelial ovarian cancer JO - Eur Rev Med Pharmacol Sci VL - 23 ID - Xu2019 ER - TY - JOUR AU - Wang, X. AU - Luo, L. AU - Dong, D. AU - Yu, Q. AU - Zhao, K. PY - 2014 DA - 2014// TI - Clusterin plays an important role in clear renal cell cancer metastasis JO - Urol Int VL - 92 ID - Wang2014 ER - TY - JOUR AU - Fu, Y. AU - Lai, Y. AU - Wang, Q. AU - Liu, X. AU - He, W. AU - Zhang, H. AU - Fan, C. AU - Yang, G. PY - 2013 DA - 2013// TI - Overexpression of clusterin promotes angiogenesis via the vascular endothelial growth factor in primary ovarian cancer JO - Mol Med Rep VL - 7 ID - Fu2013 ER - TY - JOUR AU - Sandim, V. AU - Pereira Dde, A. AU - Kalume, D. E. AU - Oliveira-Carvalho, A. L. AU - Ornellas, A. A. AU - Soares, M. R. AU - Alves, G. AU - Zingali, R. B. PY - 2016 DA - 2016// TI - Proteomic analysis reveals differentially secreted proteins in the urine from patients with clear cell renal cell carcinoma JO - Urol Oncol VL - 34 ID - Sandim2016 ER - TY - JOUR AU - Murai, J. AU - Thomas, A. AU - Miettinen, M. AU - Pommier, Y. PY - 2019 DA - 2019// TI - Schlafen 11 (SLFN11), a restriction factor for replicative stress induced by DNA-targeting anti-cancer therapies JO - Pharmacol Ther VL - 201 ID - Murai2019 ER - TY - JOUR AU - Mikaelsson, E. AU - Osterborg, A. AU - Jeddi-Tehrani, M. AU - Kokhaei, P. AU - Ostadkarampour, M. AU - Hadavi, R. AU - Gholamin, M. AU - Akhondi, M. AU - Shokri, F. AU - Rabbani, H. PY - 2013 DA - 2013// TI - A proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP) variant is uniquely expressed in chronic lymphocytic leukemia cells JO - PLoS ONE VL - 8 ID - Mikaelsson2013 ER - TY - JOUR AU - Vazquez, J. AU - Gonzalez, L. AU - Merino, A. AU - Vizoso, F. PY - 2000 DA - 2000// TI - Expression and clinical significance of apolipoprotein D in epithelial ovarian carcinomas JO - Gynecol Oncol VL - 76 ID - Vazquez2000 ER - TY - JOUR AU - Hassan, M. K. AU - Watari, H. AU - Han, Y. AU - Mitamura, T. AU - Hosaka, M. AU - Wang, L. AU - Tanaka, S. AU - Sakuragi, N. PY - 2011 DA - 2011// TI - Clusterin is a potential molecular predictor for ovarian cancer patient’s survival: targeting clusterin improves response to paclitaxel JO - J Exp Clin Cancer Res VL - 30 ID - Hassan2011 ER - TY - JOUR AU - Ballestrero, A. AU - Bedognetti, D. AU - Ferraioli, D. AU - Franceschelli, P. AU - Labidi-Galy, S. I. AU - Leo, E. AU - Murai, J. AU - Pommier, Y. AU - Tsantoulis, P. AU - Vellone, V. G. PY - 2017 DA - 2017// TI - Report on the first SLFN11 monothematic workshop: from function to role as a biomarker in cancer JO - J Transl Med VL - 15 ID - Ballestrero2017 ER -