Skip to main content

Table 1 Conformational B cell epitopes of CDPK4 protein predicted by ElliPro server

From: Bioinformatics analysis of calcium-dependent protein kinase 4 (CDPK4) as Toxoplasma gondii vaccine target

Residues

Number of Residues

Score

3D structure

A:K627, A:P628, A:A629, A:A630, A:E631, A:S632, A:P633, A:R634, A:L635, A:A636, A:G637, A:N638, A:R639, A:E640, A:R641, A:A642, A:E643, A:S644, A:A645, A:E646, A:A647, A:R648, A:G649, A:D650, A:S651, A:R652, A:S653, A:L654, A:V655, A:G656, A:S657, A:S658, A:P659, A:V660, A:H661, A:A662, A:V663, A:G664, A:K665, A:T666, A:G667, A:D668, A:V669, A:R670, A:T671, A:P672, A:V673, A:S674, A:S675, A:E676, A:G677, A:T678, A:P679, A:L680, A:R681, A:A682, A:E683, A:D684, A:L685, A:K686, A:S687, A:E688, A:D691, A:D692, A:R693, A:E694

66

0.809

View full size image

A:L950, A:D951, A:D952, A:L953, A:E954, A:R955, A:L956, A:F957, A:R958, A:K959, A:I960, A:D961, A:I962, A:D963, A:N964, A:S965, A:G966, A:C967, A:I968, A:K969, A:M970, A:D971, A:R972, A:M973, A:V974, A:A975, A:V976, A:F980, A:P984, A:R985, A:D986, A:A988, A:L989, A:R990, A:I991, A:F992, A:R994, A:I995, A:D996, A:Q997, A:T998, A:R999, A:A1000, A:E1001, A:E1002, A:I1003, A:N1004, A:Y1005, A:S1006, A:E1007, A:F1008, A:L1009, A:A1010, A:A1011, A:T1012, A:L1013, A:Q1014, A:T1015

58

0.773

View full size image

A:F845, A:G847, A:H848, A:G849, A:E852, A:I855, A:K856, A:R858, A:R859, A:D1032, A:V1033, A:D1034, A:N1035, A:S1036, A:G1037, A:H1038, A:I1039, A:S1040, A:L1041, A:E1042, A:N1043, A:L1044, A:R1045, A:G1049, A:Y1052, A:D1053, A:S1054, A:L1055, A:S1056, A:V1057, A:E1058, A:E1059, A:I1060, A:L1061, A:R1062, A:Q1063, A:C1064, A:D1065, A:K1067, A:Q1068, A:N1069, A:G1070, A:V1071, A:I1072, A:E1073, A:F1074, A:D1075, A:E1076, A:M1078, A:L1079, A:A1080, A:T1082, A:G1083, A:D1084

54

0.679

View full size image

A:R740, A:Y741, A:S742, A:E743, A:K744, A:D745, A:G747, A:R748, A:R751, A:N758, A:Q762, A:D779, A:D780, A:S781, A:D782, A:D783, A:A784, A:N823, A:E824, A:K825, A:L839, A:S840, A:P844, A:C860, A:Y862, A:N863, A:M864, A:D865, A:G866, A:P867, A:R868, A:W869, A:R870, A:G871, A:I872, A:S873, A:E874, A:Q875, A:A876, A:K877, A:H878, A:F879, A:I880, A:A881, A:S882, A:L884, A:R885, A:R886, A:N887, A:P888, A:E889, A:E890, A:R891, A:P892, A:S893, A:A894, A:E895, A:E896, A:A897, A:L898, A:K899, A:H900, A:P901, A:W902, A:L903, A:V904, A:A905, A:A906, A:E907, A:K908, A:E909, A:A910, A:L911, A:A912, A:D913, A:T914, A:E915, A:I916, A:D917, A:V918, A:S919, A:K922

82

0.667

View full size image

A:V551, A:Y552, A:H572, A:R573, A:Q574, A:S575, A:R576, A:R577

8

0.569

View full size image