Skip to main content

Table 1 Allele frequencies and forensic parameters for the 20 autosomal STR loci intheadmixed population of Maharashtra, India (n = 158)

From: A study of genomic diversity in populations of Maharashtra, India, inferred from 20 autosomal STR markers

Allele D3S1358 D1S1656 D6S1043 D13S317 Penta E D16S539 D18S51 D2S1338 CSF1PO Penta D TH01 vWA D21S11 D7S820 D5S818 TPOX D8S1179 D12S391 D19S433 FGA
5 0.054
6 0.003 0.275
7 0.019 0.060 0.009 0.111 0.032 0.003
8 0.044 0.177 0.009 0.044 0.009 0.155 0.250 0.288 0.009
9 0.003 0.009 0.127 0.013 0.149 0.009 0.209 0.310 0.073 0.032 0.155
9.3 0.142
10 0.006 0.003 0.073 0.038 0.114 0.009 0.203 0.256 0.006 0.003 0.196 0.136 0.095 0.177
10.3 0.009
10.4 0.003
11 0.165 0.272 0.244 0.177 0.307 0.025 0.335 0.269 0.253 0.316 0.427 0.114 0.006
11.3 0.009
12 0.060 0.206 0.275 0.092 0.206 0.079 0.364 0.117 0.155 0.345 0.028 0.044 0.076
12.2 0.016
12.3 0.003 0.006
13 0.139 0.120 0.060 0.051 0.165 0.149 0.076 0.076 0.003 0.032 0.165 0.003 0.168 0.320
13.2 0.022
13.3 0.028
14 0.073 0.098 0.066 0.025 0.060 0.016 0.259 0.009 0.038 0.136 0.009 0.006 0.209 0.184
14.2 0.070
14.3 0.003
15 0.335 0.136 0.006 0.089 0.184 –– 0.003 0.009 0.133 0.171 0.009 0.120
15.2 0.054
15.3 0.022
16 0.269 0.152 0.003 0.079 0.104 0.003 0.203 0.089 0.009 0.054 0.003
16.2 0.028
16.3 0.041
16.4 0.003
17 0.228 0.089 0.044 0.095 0.066 0.022 0.285 0.019 0.133 0.013
17.3 0.019 0.009
18 0.095 0.013 0.111 0.108 0.054 0.180 0.190 0.259 0.006
18.3 0.006 0.016
19 0.073 0.025 0.038 0.158 0.044 0.149 0.079
19.2 0.003 0.006
19.3 0.006 0.003
20 0.060 0.028 0.016 0.133 0.003 0.127 0.092
20.2 0.003
21 0.003 0.013 0.013 0.038 0.101 0.117
21.2 0.006
22 0.003 0.076 0.082 0.142
22.2 0.003
23 0.003 0.206 0.041 0.155
23.2 0.009
24 0.095 0.032 0.146
24.2 0.006
25 0.070 0.013 0.158
25.2 0.006
26 0.013 0.013 0.057
27 0.003 0.003 0.006 0.003
27.3 0.006
28 0.139
28.3 0.028
29 0.003 0.184
29.2 0.003
29.3 0.009
30 0.215
30.2 0.016
31 0.035
31.1 0.006
31.2 0.082
31.3 0.003
32 0.003
32.1 0.006
32.2 0.155
32.3 0.003
33.2 0.089
34.2 0.009
Pm 0.104 0.030 0.050 0.069 0.020 0.070 0.046 0.042 0.136 0.079 0.090 0.067 0.046 0.080 0.129 0.143 0.050 0.040 0.057 0.030
PIC 0.707 0.875 0.824 0.781 0.903 0.771 0.834 0.845 0.655 0.768 0.735 0.775 0.844 0.775 0.689 0.652 0.825 0.841 0.814 0.865
Hexp 0.749 0.886 0.841 0.807 0.909 0.799 0.850 0.861 0.708 0.797 0.771 0.804 0.859 0.803 0.734 0.701 0.844 0.856 0.831 0.877
Hobs 0.715 0.918 0.816 0.797 0.854 0.797 0.848 0.899 0.690 0.835 0.791 0.778 0.867 0.835 0.747 0.734 0.854 0.797 0.778 0.861
P–value 0.489 0.473 0.080 0.489 0.221 0.708 0.233 0.439 0.793 0.786 0.402 0.852 0.000 0.051 0.080 0.061 0.377 0.051 0.000 0.770
PI 3.038 3.292 2.257 2.724 3.435 2.469 3.435 1.612 1.756 1.881 2.469 3.591 4.938 3.762 2.394 2.257 3.038 6.077 2.469 1.975
PE 0.452 0.832 0.630 0.594 0.704 0.594 0.691 0.793 0.413 0.666 0.583 0.560 0.729 0.666 0.504 0.483 0.704 0.594 0.560 0.716
PD 0.896 0.970 0.950 0.931 0.980 0.930 0.954 0.958 0.864 0.921 0.910 0.933 0.954 0.920 0.871 0.857 0.950 0.960 0.943 0.970
  1. Pm matching probability, PIC polymorphic information content, Hexp expected heterozygosity,Hobs observed heterozygosity, P value HWE test, PI paternity index, PE Power of exclusion, PD power of discrimination