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Table 2 Decision tree for three viruses

From: Data mining of coronavirus: SARS-CoV-2, SARS-CoV and MERS-CoV

 

Species

Rule (default class 1)

Rule (default class 2)

Rule (default class 3)

9window

SARS-CoV-2

pos2 = D & pos9 = Q

pos2 = K & pos7 = N

 

SARS-CoV

  

MERS-CoV

pos3 = W & pos6 = V

pos1 = M & pos4 = F

pos3 = S & pos9 = L

pos1 = P & pos7 = T

pos2 = F & pos6 = C

pos5 = G & pos7 = M

pos3 = I & pos6 = V

pos4 = H & pos7 = N

pos2 = L & pos6 = R

pos4 = D & pos7 = _

pos1 = Q & pos2 = G

pos5 = E & pos7 = M

 

pos2 = L & pos6 = R

pos2 = E & pos4 = N

pos2 = L & pos4 = Y

pos1 = Y &pos4 = F

pos1 = P & pos4 = K

13window

SARS-CoV-2

 

pos12 = D & pos13 = N

SARS-CoV

pos1 = D & pos13 = V

pos12 = S & pos13 = N

MERS-CoV

pos1 = D & pos10 = I

pos11 = H & pos13 = V

pos11 = I & pos13 = V

pos5 = V & pos13 = P

pos12 L & pos13 = I

pos6 = L & pos13 = G

pos12 = A & pos13 = P

pos11 = I & pos13 = E

pos12 = V & pos13 = P

pos11 = I & pos13 = V

pos6 = I & pos13 = _

pos7 = Y & pos13 = A

pos11 = V & pos13 = L

pos3 = A & pos13 = Q

pos11 = F & pos 13 = V

pos11 = I & pos13 = V

pos5 = V & pos13 = P

pos11 = H & pos13 = V

19window

SARS-CoV-2

pos10 = T & pos12 = K

  

SARS-CoV

pos5 = L & pos10 = V

pos4 = I & pos7 = K

pos10 = I & pos13 = K

MERS-CoV

pos5 = Y & pos10 = V

pos13 = V &pos15 = K

pos4 = L & pos7 = K

pos7 = A & pos12 = Y

pos7 = I & pos19 = T

pos15 = G & pos16 = I

pos13 = L & pos15 = K

pos 13 = V & pos15 = K

pos15 = V & pos16 = A

pos15 = V & pos16 = P

pos3 = S & pos15 = G

pos12 = E & pos16 = G

pos3 = S & pos6 = S

pos7 = H & pos11 = I

pos2 = S & pos15 = Q

pos2 = E & pos15 = Q

pos4 = T & pos10 = I

pos3 = L & pos10 = L

pos7 = S & pos15 = T

pos15 = V & pos16 = S

pos15 = V & pos16 = V