Skip to main content

Table 2 Decision tree for three viruses

From: Data mining of coronavirus: SARS-CoV-2, SARS-CoV and MERS-CoV

  Species Rule (default class 1) Rule (default class 2) Rule (default class 3)
9window SARS-CoV-2 pos2 = D & pos9 = Q pos2 = K & pos7 = N  
SARS-CoV   
MERS-CoV pos3 = W & pos6 = V pos1 = M & pos4 = F
pos3 = S & pos9 = L pos1 = P & pos7 = T
pos2 = F & pos6 = C pos5 = G & pos7 = M
pos3 = I & pos6 = V pos4 = H & pos7 = N
pos2 = L & pos6 = R pos4 = D & pos7 = _
pos1 = Q & pos2 = G pos5 = E & pos7 = M
  pos2 = L & pos6 = R
pos2 = E & pos4 = N
pos2 = L & pos4 = Y
pos1 = Y &pos4 = F
pos1 = P & pos4 = K
13window SARS-CoV-2   pos12 = D & pos13 = N
SARS-CoV pos1 = D & pos13 = V pos12 = S & pos13 = N
MERS-CoV pos1 = D & pos10 = I pos11 = H & pos13 = V
pos11 = I & pos13 = V pos5 = V & pos13 = P
pos12 L & pos13 = I pos6 = L & pos13 = G
pos12 = A & pos13 = P pos11 = I & pos13 = E
pos12 = V & pos13 = P pos11 = I & pos13 = V
pos6 = I & pos13 = _
pos7 = Y & pos13 = A
pos11 = V & pos13 = L
pos3 = A & pos13 = Q
pos11 = F & pos 13 = V
pos11 = I & pos13 = V
pos5 = V & pos13 = P
pos11 = H & pos13 = V
19window SARS-CoV-2 pos10 = T & pos12 = K   
SARS-CoV pos5 = L & pos10 = V
pos4 = I & pos7 = K
pos10 = I & pos13 = K
MERS-CoV pos5 = Y & pos10 = V pos13 = V &pos15 = K
pos4 = L & pos7 = K
pos7 = A & pos12 = Y
pos7 = I & pos19 = T
pos15 = G & pos16 = I
pos13 = L & pos15 = K
pos 13 = V & pos15 = K
pos15 = V & pos16 = A
pos15 = V & pos16 = P
pos3 = S & pos15 = G
pos12 = E & pos16 = G
pos3 = S & pos6 = S
pos7 = H & pos11 = I
pos2 = S & pos15 = Q
pos2 = E & pos15 = Q
pos4 = T & pos10 = I
pos3 = L & pos10 = L
pos7 = S & pos15 = T
pos15 = V & pos16 = S
pos15 = V & pos16 = V