Primer Name | Primer Sequence (5'→3') |  | TA | # of Bands Band size | Sequence Name (GB Accession #) | Family & parent | LG | Arm |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Clock1a-1 | F-CCCAGTGTCCAGGTGAGAAA | Mapping | 57 |  |  | BR5♀ | 2 | qa |
 | R-CCTTTGTTCAGGGACACATT |  |  |  |  |  |  |  |
Clock1a-2 | F-ACCCTGGGCATCTTTCTTTT | Mapping | 57 |  |  | BR5♂ | 2 | qa |
 | R-GGAAAACTGTACCATGGGCTA |  |  |  |  |  |  |  |
Clock1b | F-ACCCAGAATACAGGGCAGAAC | Sequencing | 51 | 2 | SsaClock1b | Â | Â | Â |
 | R-CAGGATCAATTGAGTGGACTGG |  |  | 1.5 kb, 1.3 kb | (GU228525) |  |  |  |
Clock1b-2 | F-GGTGCAGATGTTCCTCCAA | Mapping | 57 |  |  | BR6♀ | 18 | q |
 | R-TCACAGAAGACTGTGAGAGGAC |  |  |  |  |  |  |  |
Clock1b-3 | F-GAGTACTGCCCTGCAGGTTG | Mapping | 55 |  |  | BR5♀ | 18 | q |
 | R-TTGACCATGGCCCTCTTATG |  |  |  |  |  |  |  |
NPAS2-2 | F-CCTCCTGAGGGGGAGAAAG | Mapping | 55 |  |  | BR6♀ | 5 | qb |
 | R-GAAGTGGCCATGTCAGGTG |  |  |  |  |  |  |  |