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Table 1 Description of spoligotyping defined lineages/sublineages among M. tuberculosis strains isolated from patients residing in the West Bank/Palestinian territories, their proportion in study versus SITVIT2 database

From: Genetic characterization of Mycobacterium tuberculosis in the West Bank, Palestinian Territories

SIT (Lineage) Octal Number Spoligotype Description Number (%) in study % in study vs. SITVIT2 database
Orphan (T1) 037637037760771 1 (3.23) 100
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Orphan (T1) 777777377660771 1 (3.23) 100
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SIT1 (Beijing) 000000000003771 2 (6.45) 0.02
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SIT4 (Unk) 000000007760771 3 (9.68) 0.93
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SIT10 (EAI8-MDG) 477777277413771 1 (3.23) 1.25
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SIT26 (CAS1-Delhi) 703777740003771 1 (3.23) 0.09
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SIT42 (LAM9)777777607760771 1 (3.23) 0.03
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SIT52 (T2) 777777777760731 1 (3.23) 0.13
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SIT53 (T1) 777777777760771 11 (35.48) 0.2
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SIT54 (Manu2) 777777777763771 1 (3.23) 0.47
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SIT62 (H1) 777777774020731 1 (3.23) 0.2
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SIT118 (T1) 777767777760771 1 (3.23) 0.71
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SIT367 (TUR) 777737404760771 1 (3.23) 8.33
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SIT390 (H3) 777777777620771 1 (3.23) 3.45
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SIT482 (BOV_1) 676773777777600 2 (6.45) 0.27
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SIT750 (H3) 003777740003171 1 (3.23) 4.76
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SIT3348* (Unk) 003777740003171 1 (3.23) 50
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  1. Note that SIT3348* was "newly created” within this study. Lineage designations were according to revised SpolDB4 rules [10]. Unk (unknown) designates patterns that did not belong to known lineages described in the database; TUR (Turkey) designates the newly assigned Turkey lineage, previously classified as LAM7-TUR [11].