Rapid diagnostics of orthopedic implant-associated infections using Unyvero ITI implant and tissue infection application is not optimal for Staphylococcus species identification

Aamot, Hege Vangstein; Johnsen, Bjørn Odd; Skråmm, Inge

doi:10.1186/s13104-019-4755-5

Table 2 Identification of pathogens by conventional culturing and Unyvero ITI application of 72 tissue biopsies from 15 orthopaedic patients with orthopaedic implant-associated infections

From: Rapid diagnostics of orthopedic implant-associated infections using Unyvero ITI implant and tissue infection application is not optimal for Staphylococcus species identification

Patient	Biopsy number	Standard culturing					Unyvero analysis
Patient	Biopsy number	Time to detection of pathogens (h)	Time to recommendation antibiotic treatment (h)	Time to complete results (h)	Pathogen ID	Growth quantification	Pathogen ID	Degree of PCR positivity (1–3)	Tissue frozen prior to analysis
101	1			137.7	Neg	–	Neg	–
101	2				Neg	–	S. pneumoniae	2
101	2				Neg	–	P. acnes	1
101	3				Neg	–	Neg^a	–
101	4				Neg	–	S. pneumoniae	2
101	5				Neg	–	S. pneumoniae	1
102	1	65.0	88.6	186.2	C. jeikeium	Broth only	CNS	1
102	2				C. jeikeium	Sparse	Corynebacterium spp.	1
102	3				C. jeikeium	Broth only	Corynebacterium spp.	1
102	5				C. jeikeium	Broth only	Neg	–	Yes
102	6				C. jeikeium	Broth only	F. magna	2	Yes
104	1	68.7	192.3	192.3	S. lugdunensis	Sparse	CNS	3
104	2				S. lugdunensis	Sparse	CNS	2
104	3				S. lugdunensis	Sparse	Neg	–
104	3				P. acnes	Sparse	Neg	–
104	4				S. lugdunensis	Sparse	CNS	2
104	5				S. lugdunensis	Sparse	Neg^a	–
104	5				P. acnes	Sparse	Neg^a	–
105	1	58.7	156.0	156.0	Neg	–	Neg	–
105	2				S. aureus	Broth only	Neg	–
105	2				S. epidermidis	Broth only	Neg	–
105	3				S. aureus	Sparse	Neg	–
					S. epidermidis	Broth only
					S. capitis	Sparse
105	4				S. aureus	Broth only	Neg	–
105	4				S. epidermidis	Broth only	Neg	–
105	5				S. aureus	Sparse	Neg	–
105	5				S. epidermidis	Broth only	Neg	–
107	1	96.0	96.0	170.8	S. epidermidis	Sparse	Neg	–
107	2				S. epidermidis	Broth only	Neg	–
107	3				S. epidermidis	Sparse	Neg	–
107	4				S. epidermidis	Broth only	Neg	–
107	5				Neg	–	Neg	–
108	1	24.3	47.8	122.8	S. aureus	Sparse	S. aureus	2
108	2				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
108	3				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
108	4				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
108	5				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
109	1	43.1	63.6	137.1	S. aureus	Sparse	Neg	–
109	2				S. aureus	Sparse	Neg	–	Yes
109	3				S. aureus	Sparse	Neg	–
109	4				S. aureus	Sparse	Neg	–
109	5				S. aureus	Sparse	Neg	–
110	1			105.8	S. aureus	Sparse	Neg	–
110	2				S. aureus	Sparse	Neg	–
110	3				S. aureus	Sparse	Neg	–
110	4				S. aureus	Sparse	Neg	–
110	5				S. aureus	Sparse	Neg	–
111	1	53.6	76.1	147.3	S. aureus	Rich	S. aureus	2
111	2				S. aureus	Rich	S. aureus	2	Yes
111	4				S. aureus	Rich	S. aureus	2
111	5				S. aureus	Rich	S. aureus	2
111	6				S. aureus	Rich	S. aureus	2
112	1	46.6	46.6	143.7	S. aureus	Sparse	S. aureus	2	Yes
112	2				S. aureus	Sparse	S. aureus	2	Yes
112	3				S. aureus	Rich	S. aureus ^a	3	Yes
112	4				S. aureus	Sparse	S. aureus	2	Yes
113	1	23.5	43.9	142.9	S. aureus	Rich	S. aureus	2	Yes
113	2				S. aureus	Rich	S. aureus	2	Yes
113	3				S. aureus	Rich	S. aureus	2	Yes
113	4				S. aureus	Rich	S. aureus	2	Yes
114	1	24.3	46.1	120.2	S. aureus	Rich	S. aureus	2	Yes
114	2				S. aureus	Moderate	S. aureus	2	Yes
114	3				S. aureus	Rich	S. aureus	3	Yes
114	4				S. aureus	Moderate	S. aureus	2	Yes
114	5				S. aureus	Moderate	S. aureus	2	Yes
115	1			167.7	Neg	–	P. acnes	2	Yes
115	2				Neg	–	P. acnes	1	Yes
115	3				Neg	–	P. acnes	2	Yes
115	4				P. acnes	Sparse	P. acnes	3	Yes
115	5				P. acnes	Sparse	P. acnes	1	Yes
116	1	26.7	69.3	119.2	S. aureus	Sparse	Neg	–
116	2				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
116	3				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
116	4				S. aureus	Sparse	Neg	–
116	5				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
117	1	20.3	115.7	115.7	S. aureus	Moderate	S. aureus	1
117	2				S. aureus	Sparse	Neg	–
117	3				S. aureus	Sparse	S. aureus	1
117	4				S. aureus	Sparse	Neg	–

^aOne PCR chamber invalid
Neg negative, CNS coagulase negative staphylocci, spp. species

Back to article page

ISSN: 1756-0500

Contact us

Submission enquiries: bmcresearchnotes@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com

BMC Research Notes

Contact us